Тип белка и его функция

Протеом — совокупность всех белков в клетке. Попытки описать протеом данного конкретного типа клетки делались во многих научных работах. Даже при использовании современной компьютерной технологии анализ протеома — трудоемкий процесс и не всегда ведет к выявлению редких белков. Цель протеомики — создание микроанализа наподобие ДНК-чипов. Вспомните, что ДНК-чип содержит гены данной клетки, смонтированные на матриксе. Гены, связанные с матриксом, подвергаются денатурации таким образом, что только одна цепь двуцепочечной молекулы ДНК входит в состав чипа. Одна цепь ДНК будет по принципу комплементарности связывать другую цепь. Вы можете пришить метку к комплементарной цепи и тогда увидите гены на чипе. Однако у белка нет подобия комплементарной цепи в молекуле ДНК. Идентификация различных белков на чипе требует наличия специфических моноклональных антител для каждого белка, находящегося на чипе.

Определение функций бесчисленного количества белков в протеоме — огромная работа, которая предстоит биоинженерам в ближайшем будущем. Исторически, такой анализ проводился путем сравнения протеомов мутантных и нормальных клеток и индивидуумов или путем проведения биохимии индивидуальных белков и сравнения структуры изучаемого белка со структурой белка с установленной функцией. Определение последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК также может оказаться полезным, потому что гены, кодирующие белки со сходной функцией, обычно расположены близко друг от друга. В некоторых случаях гены, расположенные рядом у примитивных животных, у эволюционно более развитых видов находятся на расстоянии. Возможность выключать гены, используя антисенс-технологию (применение антисмысловых последовательностей), позволит выяснить, какую функцию выполняет белок, кодируемый данным геном. В результате применения антисенс-технологии происходит дезактивация мРНК путем введения в систему молекул РНК, комплементарных мРНК. Комплементарная молекула РНК связывается с одноцепочечной молекулой мРНК, предотвращая синтез белка. Для этого типа анализа были созданы большие базы данных. Среди таких баз стоит упомянуть сеть белок-белковых взаимодействий у дрожжей, разработанную Шиковски с соавторами (2000). Анализ подобных сетей может приоткрыть функцию неохарактеризованных белков.


Оставить комментарий

Ваш комментарий